Biologiske pathways
Når genomet er sekventeret og blevet annoteret med gener, er det færdige resultat stadig en samling af forskellige dele. For at forstå hvordan en celle fungerer, er det nødvendigt at vide mere end hvilke gener der er til stede. Det kræver at man undersøger forskellige biologiske pathways. En biologisk pathway er en række af interaktioner blandt molekyler i en celle, som fører til et bestemt produkt eller en ændring i cellen. Nogle af de vigtigste og mest kendte biologiske pathways er involveret i metabolismen, reguleringen af genekspressionen og overførslen af signaler. Genregulerings pathways kan aktivere eller inaktivere gener. Signal transduktion pathways behandler signaller fra cellens indre eller ydre, og forårsager et passende respons. Metaboliske pathways udgør alle de kemiske reaktioner der forekommer i en organisme.